菩提校友会的成立追朔至1960年，恰逢菩提中学复办高中普通科（文理科），正式成为一所具备完整中学教育的佛教学府。
为了让毕业生未来依然能保持联系，卸下菩提中学校长大任的王弄书居士发起了校友入会登记，并聚首商讨有关事宜。在王校长的鼓励策动下，校友会的雏形逐渐形成。由于因缘不具足，相关负责人因种种原因分散到各地服务，校友会筹备工作被迫暂时停顿。
饮水思源 缘起菩提
1970年，时任国中校长傅晴曦居士得知数位远赴台湾的菩提校友在台湾组织了菩提学校联谊会，便有意延续王校长之愿。傅晴曦居士决定号召菩提师生重启校友会筹备工作，叮嘱在校任职的邱宏净学长召集校友，着手筹备校友会注册。历经了一段筹备时间，菩提校友会在1970年向社团注册局提出注册申请。因缘会聚之下，社团注册局於1971年批准本会申请，菩提校友会正式成立，邱宏净学长及其所带领的临时筹委会隨即上任後，为第一届校友会理事。
菩提校友会成立初期，以菩提学校礼堂作为活动场所，与在籍学生共用场地。随着时间的推移，学校迅速发展，学生人数逐渐增加，学校活动的次数亦逐渐频繁，校园场地空间不敷应用。为了不影响学校作业，菩提校友会便于1977年租借漳州会馆为会所地址及活动中心，前后长达14年。14年间，历届理事会曾多次商讨筹建会所，以立永久根基。鉴于本会成立初期，万事待兴，诸多活动必须推动策划，以至于筹建会所计划多次推迟进行。
千里之行 始于足下
1991年，恰逢菩提校友会成立20周年，时任校友会主席吴素玥学长及该届理事会再次提及筹建会所之计，并决定为本会找一个属于自己的家，以便一劳永逸地解决会所问题。经过深思熟虑，该届理事会为20周年庆典展开系列活动作为庆典节目，同时筹募会所基金。
为此，菩提校友会于同年6月1日及2日举行了三项大型活动，即“千人宴”、“菩友行”及“食品义卖会”；分别由陈美清学长、吴秀丽学长及郭秀春学长担任活动主席。20周年庆典系列活动的亮点之一是校友回校日。当年，历届毕业生受邀返校共襄盛举，使该活动成为菩提创校近半世纪的首度校友回校日。
另外，理事会为了筹建会所，另组织了建委会。在吴素玥学长以及本会顾问时任槟州首席部长许子根学长的鼎力支持下，洪月娥学长登高一呼，承担了建委会主席的重任。消息一出，各地校友即刻给予热烈响应，华教社会人士也积极给予协助。
在菩提董事、师长及华教社会人士的护持及帮助下，理想成了事实。1992年2月，在母校董事、师生以及诸多华教人士的见证下，许子根学长主持开幕仪式，菩提校友会位于拿督高雅路的新会所正式启用，本会终于有了属于自己的家。
化蛹成蝶 展翅高飞
日复日，年复年，随着校友人数的增加及菩提四校的学生日渐增多，校友会每一年颁发奖励金时人流拥挤，与会者甚至站到了楼梯处。再加上旧会所建筑物年久失修，屋顶不停渗水，多处需要重新翻修，整体会所建筑设施情况不佳。
2013年，随着会所所需维修之处逐渐增加，渗水问题也严重影响日常作业及活动的进行，时任主席林秋雅学长便在菩提小学召开商讨大会，以便作出最合适的对策。该届理事会考虑到装修费用不菲，决 定另外寻找一个空间更大，购置费用合适的新会所。
与20多年前一样，菩提校友听闻会所即将进行搬迁，纷纷慷慨解囊，出钱出力。在林秋雅学长的领导下，本会购置了位於垄尾的一所三层楼大厦，面积共六千方尺，价值1670000令吉的新会所。而后，旧会所亦随即顺利专卖。
新会所的装修工程庞大，原本的地下室内停车场被重新规划为活动室，经过了长达2年的工程，新会所于2015年正式启用。虽然如此，新会所的开幕典礼却落在2016年9月10日，配合本会庆祝纪念成立45周年隆重进行。
为了感谢傅晴曦居士对母校发展的一生贡献，以及其家人热心为校友会在傅氏家族里筹获20万令吉作为会所装修用途，新会所将大厦命名为“拿督傅晴曦校长纪念楼”。此外，为了感念协助购置旧会所的洪月娥学长，三楼佛堂命名为“月娥堂”。购置新会所时期，由于经费有限，部分基金由林秋雅学长先行代垫，转卖了旧会所以后才慢慢偿还。林秋雅学长也将最后的50000令吉捐出，作为新会所的部分装修基金，因此将地下活动室命名为“秋雅活动室”。
情牵半百 继往开来
春去冬来，四季轮转，光阴飞逝就在转眼间；2021年，本会情牵菩提半世纪。回眸来时路，本会一路走来不容易。感恩王弄书居士及傅晴曦居士两位校长的远见；更感恩诸多前辈学长的不畏艰辛、不惧苦难；一届又一届的将菩提精神传承下来。本会会员至今已经从50年前的数十位，扩增至今天的500多位。